Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXB8P17481 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB8P17481 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms