Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2A2P16615 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A2P16615 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms