Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB42P16452 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB42P16452 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB42P16452 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB42P16452 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB42P16452 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB42P16452 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB42P16452 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB42P16452 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB42P16452 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB42P16452 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB42P16452 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB42P16452 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB42P16452 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB42P16452 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB42P16452 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB42P16452 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB42P16452 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB42P16452 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB42P16452 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB42P16452 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB42P16452 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB42P16452 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB42P16452 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB42P16452 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB42P16452 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB42P16452 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB42P16452 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB42P16452 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB42P16452 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB42P16452 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB42P16452 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB42P16452 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB42P16452 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB42P16452 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB42P16452 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB42P16452 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB42P16452 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB42P16452 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB42P16452 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB42P16452 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB42P16452 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB42P16452 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB42P16452 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB42P16452 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB42P16452 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB42P16452 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB42P16452 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB42P16452 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms