Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2F2P13984 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2F2P13984 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms