Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT13P13646 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT13P13646 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT13P13646 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT13P13646 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT13P13646 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT13P13646 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT13P13646 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT13P13646 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT13P13646 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT13P13646 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT13P13646 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT13P13646 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT13P13646 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT13P13646 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT13P13646 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT13P13646 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT13P13646 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT13P13646 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT13P13646 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT13P13646 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT13P13646 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT13P13646 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT13P13646 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT13P13646 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT13P13646 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT13P13646 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT13P13646 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT13P13646 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT13P13646 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT13P13646 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT13P13646 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT13P13646 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT13P13646 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT13P13646 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT13P13646 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT13P13646 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT13P13646 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT13P13646 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT13P13646 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT13P13646 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT13P13646 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT13P13646 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT13P13646 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT13P13646 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT13P13646 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT13P13646 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT13P13646 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT13P13646 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT13P13646 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT13P13646 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT13P13646 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT13P13646 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT13P13646 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT13P13646 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT13P13646 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms