Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP3P10745 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP3P10745 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP3P10745 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP3P10745 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP3P10745 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP3P10745 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP3P10745 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP3P10745 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP3P10745 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP3P10745 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP3P10745 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP3P10745 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP3P10745 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP3P10745 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP3P10745 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP3P10745 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP3P10745 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP3P10745 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP3P10745 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP3P10745 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP3P10745 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP3P10745 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP3P10745 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP3P10745 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP3P10745 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP3P10745 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP3P10745 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP3P10745 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP3P10745 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP3P10745 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP3P10745 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBP3P10745 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP3P10745 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP3P10745 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP3P10745 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP3P10745 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP3P10745 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP3P10745 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBP3P10745 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP3P10745 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP3P10745 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP3P10745 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP3P10745 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP3P10745 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP3P10745 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP3P10745 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP3P10745 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP3P10745 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP3P10745 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP3P10745 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP3P10745 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP3P10745 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP3P10745 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP3P10745 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms