Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARAP10276 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARAP10276 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARAP10276 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARAP10276 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARAP10276 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARAP10276 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARAP10276 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARAP10276 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARAP10276 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARAP10276 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARAP10276 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARAP10276 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARAP10276 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARAP10276 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARAP10276 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARAP10276 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RARAP10276 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARAP10276 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARAP10276 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARAP10276 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARAP10276 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARAP10276 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARAP10276 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARAP10276 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARAP10276 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARAP10276 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RARAP10276 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RARAP10276 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RARAP10276 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RARAP10276 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARAP10276 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARAP10276 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARAP10276 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARAP10276 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARAP10276 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARAP10276 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARAP10276 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RARAP10276 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARAP10276 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARAP10276 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARAP10276 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARAP10276 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARAP10276 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARAP10276 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARAP10276 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARAP10276 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARAP10276 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARAP10276 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARAP10276 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARAP10276 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARAP10276 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARAP10276 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARAP10276 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARAP10276 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARAP10276 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARAP10276 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARAP10276 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARAP10276 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARAP10276 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARAP10276 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARAP10276 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARAP10276 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARAP10276 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARAP10276 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARAP10276 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARAP10276 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARAP10276 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARAP10276 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RARAP10276 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARAP10276 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms