Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC166P0CW27 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC166P0CW27 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms