Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMG1P04279 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMG1P04279 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms