Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST3O95803 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST3O95803 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST3O95803 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST3O95803 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST3O95803 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST3O95803 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST3O95803 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST3O95803 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST3O95803 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST3O95803 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST3O95803 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST3O95803 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST3O95803 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST3O95803 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST3O95803 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST3O95803 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST3O95803 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST3O95803 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST3O95803 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST3O95803 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST3O95803 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST3O95803 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST3O95803 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST3O95803 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST3O95803 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST3O95803 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST3O95803 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST3O95803 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST3O95803 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST3O95803 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST3O95803 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST3O95803 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST3O95803 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST3O95803 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST3O95803 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST3O95803 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST3O95803 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST3O95803 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST3O95803 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST3O95803 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST3O95803 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST3O95803 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST3O95803 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST3O95803 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST3O95803 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST3O95803 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST3O95803 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST3O95803 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST3O95803 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST3O95803 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST3O95803 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDST3O95803 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDST3O95803 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST3O95803 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST3O95803 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST3O95803 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST3O95803 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST3O95803 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST3O95803 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST3O95803 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST3O95803 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST3O95803 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST3O95803 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST3O95803 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST3O95803 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST3O95803 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST3O95803 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST3O95803 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST3O95803 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST3O95803 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST3O95803 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST3O95803 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms