Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC24BO95487 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms