Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFPL3O75679 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFPL3O75679 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms