Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCATO75600 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GCATO75600 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCATO75600 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCATO75600 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCATO75600 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCATO75600 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCATO75600 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCATO75600 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCATO75600 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GCATO75600 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCATO75600 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCATO75600 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCATO75600 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCATO75600 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCATO75600 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCATO75600 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCATO75600 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCATO75600 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCATO75600 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCATO75600 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCATO75600 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCATO75600 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCATO75600 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCATO75600 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCATO75600 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCATO75600 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCATO75600 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCATO75600 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GCATO75600 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCATO75600 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCATO75600 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCATO75600 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCATO75600 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCATO75600 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCATO75600 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCATO75600 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCATO75600 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCATO75600 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCATO75600 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCATO75600 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCATO75600 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCATO75600 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCATO75600 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCATO75600 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GCATO75600 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCATO75600 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCATO75600 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCATO75600 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCATO75600 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCATO75600 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCATO75600 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCATO75600 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCATO75600 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCATO75600 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCATO75600 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCATO75600 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms