Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS26AO75436 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms