Protein–RNA interactions for Protein: O75409

HYPM, Huntingtin-interacting protein M, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HYPMO75409 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HYPMO75409 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HYPMO75409 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HYPMO75409 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HYPMO75409 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HYPMO75409 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HYPMO75409 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HYPMO75409 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HYPMO75409 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HYPMO75409 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HYPMO75409 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HYPMO75409 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HYPMO75409 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HYPMO75409 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HYPMO75409 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HYPMO75409 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HYPMO75409 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HYPMO75409 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HYPMO75409 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HYPMO75409 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HYPMO75409 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HYPMO75409 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms