Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN2BO60939 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN2BO60939 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms