Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP8B3O60423 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B3O60423 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B3O60423 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms