Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF1CO43896 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms