Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3O43889 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3O43889 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3O43889 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3O43889 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3O43889 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3O43889 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3O43889 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3O43889 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3O43889 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3O43889 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3O43889 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3O43889 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3O43889 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3O43889 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3O43889 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3O43889 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3O43889 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3O43889 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3O43889 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB3O43889 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3O43889 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3O43889 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3O43889 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREB3O43889 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3O43889 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3O43889 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3O43889 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3O43889 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3O43889 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3O43889 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3O43889 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3O43889 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3O43889 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3O43889 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3O43889 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3O43889 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3O43889 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3O43889 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3O43889 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3O43889 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3O43889 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3O43889 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3O43889 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3O43889 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3O43889 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3O43889 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3O43889 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3O43889 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms