Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRC1O43663 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRC1O43663 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRC1O43663 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRC1O43663 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRC1O43663 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRC1O43663 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRC1O43663 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRC1O43663 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRC1O43663 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRC1O43663 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRC1O43663 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRC1O43663 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRC1O43663 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRC1O43663 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRC1O43663 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRC1O43663 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRC1O43663 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRC1O43663 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRC1O43663 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRC1O43663 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRC1O43663 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRC1O43663 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRC1O43663 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PRC1O43663 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRC1O43663 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRC1O43663 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRC1O43663 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRC1O43663 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRC1O43663 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRC1O43663 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRC1O43663 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRC1O43663 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRC1O43663 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRC1O43663 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRC1O43663 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRC1O43663 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRC1O43663 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRC1O43663 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRC1O43663 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRC1O43663 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRC1O43663 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRC1O43663 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRC1O43663 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRC1O43663 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRC1O43663 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRC1O43663 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRC1O43663 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRC1O43663 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRC1O43663 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRC1O43663 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRC1O43663 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRC1O43663 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRC1O43663 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRC1O43663 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRC1O43663 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRC1O43663 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRC1O43663 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRC1O43663 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRC1O43663 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRC1O43663 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRC1O43663 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRC1O43663 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRC1O43663 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRC1O43663 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRC1O43663 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRC1O43663 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRC1O43663 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRC1O43663 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRC1O43663 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRC1O43663 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRC1O43663 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms