Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2DO15514 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR2DO15514 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2DO15514 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms