Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF10O15013 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF10O15013 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF10O15013 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF10O15013 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ARHGEF10O15013 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF10O15013 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF10O15013 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARHGEF10O15013 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
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