Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASKO14936 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASKO14936 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASKO14936 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASKO14936 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASKO14936 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASKO14936 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASKO14936 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASKO14936 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASKO14936 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASKO14936 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASKO14936 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASKO14936 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASKO14936 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASKO14936 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASKO14936 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASKO14936 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASKO14936 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASKO14936 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASKO14936 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASKO14936 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASKO14936 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASKO14936 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASKO14936 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASKO14936 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASKO14936 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASKO14936 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CASKO14936 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASKO14936 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASKO14936 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASKO14936 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASKO14936 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASKO14936 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASKO14936 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASKO14936 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASKO14936 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASKO14936 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASKO14936 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASKO14936 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASKO14936 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASKO14936 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASKO14936 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASKO14936 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASKO14936 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms