Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAMP3O14828 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms