Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPEO14579 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPEO14579 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPEO14579 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPEO14579 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPEO14579 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPEO14579 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPEO14579 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPEO14579 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COPEO14579 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPEO14579 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPEO14579 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPEO14579 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPEO14579 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPEO14579 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPEO14579 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPEO14579 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPEO14579 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPEO14579 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPEO14579 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPEO14579 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPEO14579 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPEO14579 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPEO14579 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPEO14579 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPEO14579 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPEO14579 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPEO14579 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPEO14579 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPEO14579 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPEO14579 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPEO14579 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPEO14579 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPEO14579 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPEO14579 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPEO14579 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPEO14579 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPEO14579 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPEO14579 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPEO14579 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPEO14579 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPEO14579 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPEO14579 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPEO14579 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPEO14579 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPEO14579 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPEO14579 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPEO14579 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPEO14579 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPEO14579 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPEO14579 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPEO14579 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPEO14579 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPEO14579 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPEO14579 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPEO14579 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPEO14579 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms