Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPSO00116 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPSO00116 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPSO00116 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPSO00116 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPSO00116 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPSO00116 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPSO00116 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPSO00116 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPSO00116 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPSO00116 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPSO00116 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPSO00116 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPSO00116 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGPSO00116 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGPSO00116 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGPSO00116 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGPSO00116 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGPSO00116 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGPSO00116 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPSO00116 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPSO00116 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPSO00116 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPSO00116 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPSO00116 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPSO00116 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPSO00116 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPSO00116 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms