Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KRW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KRW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KRW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KRW8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KRW8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KRW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
J3KRW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3KRW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3KRW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3KRW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
J3KRW8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3KRW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
J3KRW8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
J3KRW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KRW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KRW8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KRW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KRW8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KRW8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KRW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KRW8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KRW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KRW8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KRW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KRW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KRW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
J3KRW8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
J3KRW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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