Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H7C417 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H7C417 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
H7C417 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H7C417 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H7C417 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H7C417 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H7C417 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H7C417 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H7C417 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
H7C417 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H7C417 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H7C417 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H7C417 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H7C417 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H7C417 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H7C417 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H7C417 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H7C417 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
H7C417 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H7C417 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H7C417 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H7C417 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H7C417 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H7C417 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H7C417 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H7C417 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H7C417 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H7C417 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H7C417 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H7C417 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H7C417 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H7C417 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
H7C417 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H7C417 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H7C417 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H7C417 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
H7C417 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H7C417 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C417 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C417 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C417 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C417 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms