Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB8E9PQR5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPIPB8E9PQR5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB8E9PQR5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms