Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
E9PCH4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
E9PCH4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
E9PCH4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
E9PCH4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
E9PCH4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
E9PCH4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
E9PCH4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
E9PCH4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
E9PCH4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
E9PCH4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
E9PCH4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
E9PCH4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
E9PCH4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
E9PCH4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
E9PCH4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
E9PCH4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
E9PCH4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
E9PCH4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
E9PCH4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
E9PCH4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
E9PCH4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
E9PCH4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
E9PCH4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
E9PCH4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
E9PCH4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
E9PCH4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
E9PCH4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
E9PCH4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
E9PCH4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
E9PCH4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
E9PCH4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
E9PCH4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
E9PCH4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
E9PCH4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
E9PCH4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
E9PCH4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
E9PCH4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
E9PCH4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
E9PCH4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
E9PCH4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
E9PCH4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
E9PCH4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
E9PCH4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
E9PCH4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
E9PCH4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
E9PCH4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
E9PCH4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
E9PCH4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
E9PCH4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
E9PCH4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
E9PCH4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
E9PCH4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
E9PCH4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
E9PCH4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
E9PCH4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
E9PCH4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
E9PCH4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
E9PCH4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
E9PCH4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
E9PCH4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
E9PCH4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
E9PCH4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
E9PCH4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
E9PCH4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
E9PCH4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
E9PCH4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
E9PCH4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
E9PCH4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
E9PCH4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
E9PCH4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
E9PCH4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
E9PCH4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
E9PCH4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
E9PCH4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
E9PCH4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
E9PCH4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
E9PCH4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
E9PCH4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
E9PCH4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
E9PCH4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
E9PCH4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
E9PCH4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
E9PCH4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
E9PCH4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
E9PCH4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
E9PCH4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
E9PCH4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
E9PCH4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
E9PCH4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
E9PCH4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
E9PCH4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
E9PCH4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
E9PCH4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
E9PCH4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
E9PCH4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
E9PCH4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
E9PCH4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
E9PCH4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
E9PCH4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms