Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L11C9JVI0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP17L11C9JVI0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms