Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM1B2RUZ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM1B2RUZ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms