Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HIGD1CA8MV81 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms