Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE1LA8MT33 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1LA8MT33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1LA8MT33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms