Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC69A6NI79 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC69A6NI79 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms