Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POMPQ9Y244 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms