Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms