Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms