Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CELF4Q9BZC1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CELF4Q9BZC1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms