Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PACSIN1Q9BY11 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms