Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms