Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms