Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GAB3Q8WWW8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GAB3Q8WWW8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms