Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ1

DEFB133, Beta-defensin 133, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB133Q30KQ1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DEFB133Q30KQ1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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DEFB133Q30KQ1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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