Protein–RNA interactions for Protein: Q17RC7

EXOC3L4, Exocyst complex component 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC3L4Q17RC7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOC3L4Q17RC7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOC3L4Q17RC7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms