Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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