Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms