Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM25Q14258 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM25Q14258 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms