Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTK7Q13308 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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