Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms